Penitenciarul Brăila este organizat pe sectoare de activitate, servicii, birouri, şi compartimente, astfel:
- Sectorul operativ
- Serviciul siguranţa deţinerii
- Serviciul regim penitenciar
- Sectorul educaţie şi asistenţă psihosocială
- Biroul Educaţie
- Biroul Asistenţă Psihosocială
- Sectorul economico administrativ
- Serviciul Logistică
- Serviciul financiar contabil
- Birou prevenirea criminalităţii şi terorismului
- Birou resurse umane şi formare profesională
- Cabinet medical
- Compartiment juridic
- Compartiment secretariat
- Compartiment informaţii clasificate
- Compartimentul managementul situaţiilor de urgenţă
- Compartimentul tehnologia informaţiei
Activitatea serviciilor, birourilor şi compartimentelor din cadrul Penitenciarului Brăila este reglementată prin Hotărârea Guvernului nr.756 din 12 octombrie 2016 pentru organizarea, funcționarea și atribuțiile Administrației Naționale a Penitenciarelor și pentru modificarea Hotărârii Guvernului nr. 652/2009 privind organizarea și funcționarea Ministerului Justiției
Pentru a vizualiza organigrama click aici.